Resum: Aquest grup de recerca provat si la variació genètica és associat amb la topologia de lesió de l’esclerosi múltiple per a un estudi de l’Associació del genoma (GWAS). Els investigadors provat aquesta hipòtesi mitjançant l’anàlisi de la distribució de les lesions de l’esclerosi múltiple i utilitzar aquesta mesura com un tret en un GWAS.Resumen: Este grupo de investigación probó si la variación genética se asocia con esclerosis múltiple topología de lesión por un estudio de Asociación de genoma (GWAS). Los investigadores probaron esta hipótesis analizando la distribución de las lesiones de esclerosis múltiple y utilizaron esa medida como un rasgo en un GWAS.
Imatges de ressonància magnètica de 3T utilitzat exploracions de T1 ponderat vòxel-nivell de reconstruir la topologia en 3D de les lesions en 284 temes amb l’esclerosi múltiple provat i si era un fenotip hereditària. Els deu primers components principals són calculades per tal de centrar-se en la distribució de la lesió i dur a terme estudis GWAS en cada un d’aquests.
Els investigadors van trobar 31 importants associacions amb vuit component, que representa la variació de la topologia de la lesió a la població. La majoria es poden associar amb la funció de gens associats de creixement neuronal i immune cel·lular i la mielina.
Els resultats mostren trets com quantitatives deriva MRI del cervell pot ser utilitzat com a variables dependents en un GWAS. En el futur, la integració dels conjunts de dades que imaging i genètics és probable que convertir-se en una eina clau per a la comprensió dels processos biològics complexos de l’esclerosi múltiple.
Visió de conjunt
Imatge per ressonància magnètica cerebral és àmpliament utilitzat com una eina de diagnòstic i seguiment de l’esclerosi múltiple i proporciona un no invasiva, reproduïble per fer un seguiment de la malaltia i sensible.
Característiques topològica de la distribució i forma de les lesions són reconeguts com a marcadors neuroradiològiques importants en el diagnòstic de l’esclerosi múltiple, encara que aquestes han estat molt menys ben caracteritzat quantitativament tenen mesures tradicionals, com ara hyperintense (2) T o T (1) hypointense lesió volums.
Aquí, fem servir vòxel-nivell 3 T T de ressonància magnètica (1) – ponderada escanneja per a reconstruir la topologia en 3D de les lesions en 284 temes amb l’esclerosi múltiple provat i si és un fenotip hereditària. Per tant genotips d’un estudi d’Associació del genoma en aquests mateixos individus van ser extrets i genètics associacions amb la càrrega de la lesió, forma i distribució topològica buscat. Probabilitat de lesions mapes s’han creat per identificar les àrees afectades per freqüentment i valorar la distribució global de lesions, T (1) sobre el tema com una població sencera. Llavors vam desenvolupar un algorisme original per cúmul lesió vòxels adjacents (cluxels) a cada tema i provat si cluxel la topologia és significativament associat amb cap al nostre polimorfisme de nucleòtids simples conjunt de dades. Per centrar-se en els patrons de distribució de la lesió, calculat els 10 primers components principals.
Encara que el principal component 1 correlacionat amb la càrrega de la lesió, cap dels components restants ortogonals correlacionat amb qualsevol altra variable coneguda. Llavors va fer genoma d’estudis d’associació en cada un d’ells i trobar associacions significatives 31 (taxa de fals descobriment < 0,01) amb component principal 8, que representa una variació de la topologia de la mode de lesió en la població.
La majoria de loci es pot relacionar amb gens relacionats amb la funció de cèl·lules immunitàries i la mielina i el creixement neuronal; alguns (SYK, MYT1L, TRAPPC9, SLITKR6 i RIC3) han estat prèviament associat amb la distribució de les lesions de la substància blanca en l’esclerosi múltiple.
Finalment, utilitzar un enfocament de Bioinformàtica per identificar d’una xarxa de 48 proteïnes d’interacció que mostra d’associacions de genètics (P < 0,01) amb la topologia de cluxel en l’esclerosi múltiple. La xarxa també conté les proteïnes expressats en cèl·lules immunitàries i s’enriqueix en molècules expressades en el sistema nerviós central que contribuir a la regeneració i desenvolupament neuronal. Mostrar els nostre resultats com quantitatives trets deriva d’imatges de ressonància magnètica dels cervells de pacients amb esclerosi múltiple pot ser utilitzat com a variables dependents d’un genoma d’estudi de l’Associ
Amb la Disponibilitat estesa d’informàtica potent i la disponibilitat de les poblacions de genotipadas, integració de conjunts de dades que imaging i genètics és probable que convertir-se en una eina clau per entendre els complexos processos biològics de l’esclerosi múltiple i altres malalties del cervell.
Autors: PA Gourraud, Sdika M, Khankhanian P
Font: cervell. El 13 de febrer de 2013. & Pubmed PMID: 23412934 (20/02/13)
INFORMACIÓ ORIGINAL EXTRETA DE:
http://www.ms-uk.org/index.cfm/MSnews
TRADUÏT AUTOMÀTICAMENT PER:
LA BARRA DE GOOGLE
Utilizaron imágenes de resonancia magnética de 3T voxel-nivel T1 cargó exploraciones para reconstruir la topología 3D de lesiones en 284 sujetos con esclerosis múltiple y probado si se trataba de un fenotipo hereditario. Se computan los diez primeros componentes principales con el fin de centrarse en la distribución de la lesión y llevado a cabo estudios GWAS en cada uno de estos.
Los investigadores encontraron 31 asociaciones significativas con componente ocho, que representa la variación de la topología de la lesión en la población. La mayoría puede asociarse a función de genes relacionados con inmune celular y a la mielina y crecimiento neural.
Los resultados muestran cómo los caracteres cuantitativos derivan de MRI del cerebro pueden utilizarse como variables dependientes en un GWAS. En el futuro, la integración de conjuntos de datos de imágenes y genéticas es probable para convertirse en una herramienta dominante para la comprensión de los complejos procesos biológicos de la esclerosis múltiple.
Resumen
La proyección de imagen de resonancia magnética del cerebro es ampliamente utilizada como una herramienta de diagnostico y monitoreo en la esclerosis múltiple y proporciona una forma no invasiva, sensible y reproducible para realizar un seguimiento de la enfermedad.
Topológicas características relativas a la distribución y la forma de lesiones se reconocen como marcadores de neuroradiological importantes en el diagnóstico de esclerosis múltiple, aunque éstos han sido mucho menos bien caracterizados cuantitativamente que tienen medidas tradicionales como T(2) hyperintense o T(1) hypointense lesión volúmenes.
Aquí, utilizamos voxel-nivel 3 T resonancia magnética T (1)-weighted exploraciones para reconstruir la topología 3D de lesiones en 284 sujetos con esclerosis múltiple y probado si se trata de un fenotipo hereditario. Para ello, se extrajeron los genotipos de un estudio de Asociación de genoma publicado sobre estos mismos individuos y asociaciones genéticas con la carga de la lesión, forma y distribución topológica ha buscado. Mapas de probabilidad de lesión fueron creados para identificar las zonas afectadas con frecuencia y para evaluar la distribución general de lesiones T(1) en la población de tema en su conjunto. Entonces desarrollamos un algoritmo original para cluster vóxeles lesional adyacente (cluxels) en cada tema y probado si cluxel topología se asoció significativamente con cualquier polimorfismo de nucleótido en nuestro conjunto de datos. Para centrarse en los patrones de distribución de la lesión, computan los 10 primeros componentes principales.
Aunque el componente principal 1 correlacionadas con la carga de la lesión, ninguno de los restantes componentes ortogonales correlacionados con cualquier otra variable conocida. Luego realizó estudios de Asociación de genoma en cada uno de ellos y encontraron 31 asociaciones significativas (tasa de falso descubrimiento < 0,01) con componente principal 8, que representa un modo de variación de la topología de la lesión en la población.
La mayoría de los loci puede vincularse con genes relacionados con la función de las células inmunes y mielina y crecimiento neuronal; algunos (SYK, MYT1L, TRAPPC9, SLITKR6 y RIC3) se han asociado previamente a la distribución de las lesiones de la materia blanca en la esclerosis múltiple.
Finalmente, utilizamos un enfoque de bioinformática para identificar una red de 48 proteínas interactuantes que muestran asociaciones genéticas (P < 0,01) con topología de cluxel en la esclerosis múltiple. Esta red también contiene las proteínas expresadas en las células inmunes y se enriquece en moléculas expresadas en el sistema nervioso central que contribuyen a la regeneración y el desarrollo neuronal. Nuestro resultados muestran cómo los caracteres cuantitativos derivan de imágenes de resonancia magnética del cerebro de pacientes con esclerosis múltiple pueden utilizarse como variables dependientes en un estudio de Asociación de genoma.
Con la disponibilidad generalizada de potente informática y la disponibilidad de las poblaciones de genotipadas, integración de conjuntos de datos de imágenes y genéticos es probable para convertirse en una herramienta dominante para entender los procesos biológicos complejos de esclerosis múltiple y otros trastornos cerebrales.
Autores: Gourraud PA, Sdika M, Khankhanian P
Fuente: cerebro. El 13 de febrero de 2013. & Pubmed PMID: 23412934 (20/02/13)
INFORMACIÓN ORIGINAL EXTRAÍDA DE
http://www.ms-uk.org/index.cfm/MSnews
TRADUCIDO AUTOMÁTICAMENTE POR:
LA BARRA DE GOOGLE